主要的永久性工程包括： （a）新啟德站及相關A，B及D入口、通道、通風設施及建築及樓宇裝修工程； （b）宋皇臺站緊急出口（SUA）及相關通道和入口； （c）路軌工程豎井通道； （d）以明挖回填方式建造的北行及南行隧道，來往啟德站與合約編號1109列明的介面邊界； （e）以暗挖方式建造前九龍城碼頭緩衝區內北行及南行的露天隧道； （f）以明挖回填方式建造的北行及南行隧道，來往啟德站與合約編號1107列明的介面邊界； （g）供應及安裝支架，包含固定在建築物內的組件，其中包括由他人提供或設計的裝置及機電工程的雜項裝置，如照明、指示牌、交通控制設施及環境美化工程； （h）砍樹、樹木補償工程及環境美化工程； （i）屋宇裝備工程的鑄件； （j）指定及關聯合約相關介面規定； （k）根據指定及關聯合約，建造車站、入口、隧道、豎井及供安裝設備及服務用通道的民用設施； （l）建造公用設施裝置，連接現有港鐵網路及啟德站